L’école de la Magdeleine accueille les élèves de 4e et 5e secondaire provenant des écoles secondaires Fernand-Seguin (Candiac), Saint-François-Xavier (La Prairie), Jacques-Leber (Saint-Constant) et des Timoniers (Sainte-Catherine).
L’école accueille aussi les élèves de la 1re à la 5e secondaire du Programme d’éducation internationale (PEI) provenant des écoles primaires Jean-Leman, Plein-Soleil, Saint-Marc (Candiac), Jacques-Barclay (Saint-Mathieu), des Moussaillons-et-de-la-Traversée (Saint-Philippe), de la Petite-Gare, Émilie-Gamelin, Jean-XXIII, Notre-Dame-Saint-Joseph (La Prairie), de l’Aquarelle-Armand-Frappier, Félix-Leclerc, Piché-Dufrost, Vinet-Souligny (Saint-Constant), Louis-Lafortune, des Cheminots (Delson), de l’Odyssée, des Bourlingueurs, Saint-Jean (Sainte-Catherine), Saint-Édouard (Saint-Édouard), Daigneau (Napierville), Saint-Bernard (Saint-Bernard-de-Lacolle), Saint-Patrice (Saint-Patrice-de-Sherrington) et Saint-Romain (Hemmingford).